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人間や他の動物の消化管には、消化を助ける多くの種類の細菌が含まれていますが、これらの生物の一部は人間に感染を引き起こす可能性があります。人が細菌感染しているかどうかを判断するために、医師は便のサンプルを採取し、その後細菌が増殖するような条件にさらすように依頼します。培養中に細菌が出現した場合、分析の責任者はサンプルを顕微鏡で観察し、化学的検査を行ってそのタイプを識別します。人間で最も一般的な腸内細菌感染症は、サルモネラ菌、赤痢菌、カンピロバクター、および特定の大腸菌（E. coli）です。
サルモネラ
サルモネラ菌（鳥、爬虫類、一部の哺乳類の腸で一般的に見られる細菌）は、サルモネラ症と呼ばれる下痢感染症を引き起こします。感染した動物の排泄物を扱う人々と同様に、それは通常、調理されていない肉または他の汚染された食物を扱うか、食べる人々に渡されます。サルモネラ感染症は、下痢、腹部けいれん、発熱などの症状を引き起こします。サルモネラ症は、子供、高齢者、または免疫力が低下した人々に深刻な病気を引き起こす可能性があります。ほとんどの人は治療なしで回復します。誰かがサルモネラ菌を持っている場合、体を水分を保つために水分を飲む必要があります。
E.コリ（O157株）
バクテリアの多様なグループである大腸菌は、一般的に無害です。実際、それは通常人間の腸に存在します。ただし、これらの細菌の一部の株は、腸、腎臓、および血液を損傷する可能性がある毒物または毒素を生成します。大腸菌O157は、下痢性疾患を引き起こす志賀と呼ばれる毒素を生成します。大腸菌感染症の症状には、胃のむかつき、血性下痢、嘔吐、脱水症などがあります。一部の感染症は軽度ですが、他の感染症は深刻であるか、特に幼児や高齢者にとって生命を脅かす可能性があります。最良の治療は、病気が進行している間も水分を補給することです。
赤痢菌
赤痢菌は、赤痢と呼ばれる消化管に感染症を引き起こします。これは通常、汚染された食品や飲み物を食べることによってヒトに感染します。大腸の粘膜を攻撃する毒素を産生し、腸壁の腫れ、潰瘍、血性下痢を引き起こします。症状には、腹部のけいれん、重度の下痢、嘔吐、痛みを伴う排便、高熱、食欲不振などがあります。赤痢は幼児でより頻繁に発生します。医師はこの病気を治療するためにアンピシリンのような抗生物質を処方します。水分補給も治療の重要な部分です。
カンピロバクター
米国農務省によると、下痢を引き起こすカンピロバクター属細菌は、食中毒の2番目に多い原因です。彼らは多くの家畜や野生動物の腸で発見され、それらの糞便を通して伝染することができます。人々は、汚染された肉（特に鶏肉）、水、または低温殺菌されていない牛乳を消費することで、カンピロバクター感染症にかかります。症状には、下痢、腹部のけいれん、発熱などがあります。治療は脱水症と闘うために水分を飲むことから成ります。通常、この感染症は自然に治りますが、重症の場合は抗生物質による治療が必要になることがあります。人々は肉をよく調理し、精製水と低温殺菌された牛乳を飲むことにより、カンピロバクター感染を防ぐことができます。
